Родился 1 марта 1918 года в деревне Антропово Усвятского района в семье крестьянина. Работал механизатором в колхозе. В 1938 году призван в Красную армию, в танковую часть.
Перед Великой Отечественной войной стал инструктором курсов по подготовке младших танковых специалистов. В апреле 1942 года младший лейтенант В. Е. Бонин был назначен командиром танка 108-й танковой бригады 9-го танкового корпуса. Участвовал в боях под Ржевом, в Курской битве, в освобождении левобережной Украины.
Особенно отличился коммунист В. Е. Бонин в боях за Одер. В составе батальона 29 января 1945 года он участвовал в овладении г. Цюллихау (Сулехаув, Польша), форсировании реки Одер и захвате плацдарма. Батальон был окружен и девять суток до подхода подкреплений удерживал занятый рубеж, отбив девять контратак противника. В этой тяжелой обстановке В. Е. Бонин показал личный героизм, самообладание, высокое воинское мастерство. Только в течение одних суток его танковый экипаж уничтожил 3 пушки, 3 миномета, 2 пулеметные точки, 12 автомашин.